Fillmore, C. and P. Kay (1999) "Regularity and Idiomaticity in Grammatical Constructions: The Case of Let Alone," Language, 64, 501-538.

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how come?はwhy?と完全に等価ではない。whyが理由だけを尋ねているのに対して,how comeは疑問の対象となった事態が何らかの点で予想外である,または辻褄が合わない,ということを伝えているからである。